引起男人不孕不育的原因较多，其中约有30% - 40%与男性自身因素相关，主要包括以下几方面。
生殖系统疾病因素
先天性生殖系统异常： 比如先天性睾丸发育不全，会导致睾丸生精功能障碍，使得精子生成数量减少或质量下降。还有隐睾，若睾丸未能正常下降至阴囊，处于腹腔或腹股沟等温度相对较高的部位，会影响精子的正常生成，因为睾丸生成精子需要相对低温的环境。后天性生殖系统疾病： 附睾炎较为常见，长期的附睾炎会影响附睾的功能，附睾是储存和输送精子的重要器官，炎症可能导致精子输送受阻或精子活力降低。前列腺炎也会对生育产生影响，前列腺液是精液的重要组成部分，前列腺炎会使前列腺液的成分发生改变，影响精子的存活和活动能力。
内分泌因素
垂体病变： 垂体瘤是常见的垂体病变，垂体瘤可能会影响促性腺激素的分泌，促性腺激素对睾丸的生精功能和内分泌功能起着重要的调节作用，分泌异常会导致睾丸生精障碍和性激素水平异常。甲状腺疾病： 甲状腺功能亢进或减退都会影响内分泌系统，进而影响生殖功能。甲状腺功能亢进时，体内甲状腺激素水平过高，会干扰下丘脑 - 垂体 - 性腺轴的正常功能；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，也会导致性激素分泌紊乱，影响精子的生成和性功能。
免疫因素
自身免疫性睾丸炎： 人体的免疫系统错误地将睾丸组织当作外来异物进行攻击，产生自身抗体，这些抗体破坏睾丸的生精细胞等，导致精子生成受到影响。精液自身免疫： 男性自身产生抗精子抗体，抗精子抗体可以凝集精子、抑制精子的活动能力等，从而影响精子与卵子的结合，导致不育。
不良生活方式因素
吸烟酗酒： 长期大量吸烟，香烟中的尼古丁等有害物质会影响精子的生成和活力，降低精子的质量。酗酒会损害睾丸的生精功能，导致精子数量减少、畸形率增加。一般来说，每天吸烟超过20支，饮酒量每天超过500毫升白酒当量，对生育的不良影响会较为明显。长期高温环境： 长时间处于高温环境中，比如经常洗热水澡、泡温泉时间过长、长期穿紧身裤等，会使阴囊局部温度升高，而睾丸生精需要适宜的温度，高温会抑制精子的生成，影响精子的质量。