月经结束后两天同房有怀孕可能，但几率不大。以下进行详细阐述：
一、部分女性月经周期不规律，排卵时间不定，即便月经刚结束两天也可能怀孕。
1.女性月经周期受多种因素影响，如激素水平、体内卵巢中枢调节等。
(1)这些因素可能会使排卵情况变得不那么规律和准确。
(2)当月经周期不规律时，排卵时间也难以准确预测。
2.而在这种情况下，月经结束后两天同房，就有受孕的可能性。
二、大部分月经周期正常的女性，易怀孕时期是排卵期，即下次月经来潮前第14天，此时同房怀孕几率大，月经结束后两天不属于排卵期，受孕几率较小。
1.正常情况下，女性在排卵期受孕机会更高。
(1)这是因为此时卵子排出，与精子结合的机会较大。
(2)而月经结束后两天通常不是排卵期，所以相对不易受孕。
2.但整个月经周期并非完全固定不变。
(1)可能会因外界因素如疾病、情绪等而有所波动。
(2)从而也可能影响排卵时间。
要确定月经结束后两天同房是否会怀孕，建议去医院检查。总之，月经结束后两天同房有怀孕的可能，只是几率大小因个体情况而异，需要综合多方面因素来判断。