脖子上皮下起小疙瘩，可能是以下原因引起：
1.丝状疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染皮肤黏膜所引起的良性赘生物。可通过直接或间接接触传播，比如搔抓患处后接触身体其他部位，或与患者共用毛巾、衣物等。通常表现为细长的丝状突起，颜色多为正常肤色或淡褐色，好发于颈部、额头、眼睑等部位。一般无自觉症状，但有时可能会因为搔抓而出现瘙痒感。丝状疣通常可以通过物理治疗、外用药物或手术切除等方法进行治疗。
2.痤疮：是一种毛囊皮脂腺的慢性炎症性疾病，好发于青少年。可与雄激素水平增加、皮脂分泌增加、痤疮丙酸杆菌繁殖、毛囊皮脂腺导管角化异常以及遗传等因素有关。痤疮可表现为粉刺、丘疹、脓疱、结节、囊肿等多种类型，常发于面部、颈部、胸背部等皮脂腺丰富的部位。痤疮的治疗方法包括外用药物（如维A酸乳膏、过氧化苯甲酰凝胶等）、口服药物（如抗生素、异维A酸等）、物理治疗（如光疗、激光治疗等）等。
3.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。传染性软疣的特征为皮肤上出现半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。传染性软疣通常可以通过刮除、冷冻、激光等方法进行治疗。
4.其他原因：脖子上皮下起小疙瘩还可能是脂肪瘤、皮脂腺囊肿、皮肤纤维瘤等疾病引起。
如果脖子上的小疙瘩持续不消失或逐渐增大，建议及时就医，明确诊断后进行相应的治疗。同时，要注意保持皮肤清洁，避免搔抓患处，避免感染。