六味地黄丸常可与一些药物搭配以增强疗效，比如与左归丸搭配，左归丸能滋肾补阴，六味地黄丸侧重补肾阴，二者联用对于肾阴不足引起的腰膝酸软等情况可能有更好效果。一般来说，在中医辨证论治基础上合理配伍能发挥较好作用，但具体还需根据个体情况。
与其他补肾阴药物搭配
与左归丸搭配：左归丸主要成分有熟地黄、菟丝子等，能滋肾补阴，填精益髓。六味地黄丸主要由熟地黄、山茱萸等组成，侧重补肾阴。两者联合对于肾阴不足导致的头晕耳鸣、腰膝酸软等有一定协同作用，不过要在医生指导下根据患者具体症状来用。与大补阴丸搭配：大补阴丸能滋阴降火，成分有熟地黄、知母等。六味地黄丸与之联用，对于阴虚火旺引起的潮热盗汗等情况可能有更好的改善作用，同样需在中医师辨证后应用。
与调节免疫系统药物搭配
与转移因子口服液搭配：转移因子口服液可调节机体免疫功能。有研究发现，肾阴虚患者常存在免疫功能紊乱情况，六味地黄丸能调节机体免疫，与转移因子口服液联用，对于一些因免疫功能异常导致的疾病，如反复呼吸道感染等，可能有一定辅助调节作用，但具体要在医生评估下使用。与胸腺肽肠溶片搭配：胸腺肽肠溶片能调节机体免疫功能。对于肾阴亏虚且免疫功能低下的人群，六味地黄丸联合胸腺肽肠溶片，可能有助于改善免疫状态，但使用时要注意监测身体反应。
与改善代谢相关药物搭配
与二甲双胍搭配：对于伴有肾阴亏虚的2型糖尿病患者，六味地黄丸可辅助调节肾阴。有研究显示，六味地黄丸联合二甲双胍对于改善患者血糖、调节脂代谢等可能有一定协同作用，但需在医生指导下，因为要监测血糖变化以及药物相互作用情况。与阿托伐他汀搭配：对于存在肾阴不足且血脂异常的人群，六味地黄丸有一定调节机体代谢的潜在作用，与阿托伐他汀联用，在调节血脂等方面可能有一定协同，但同样要在医生指导下，注意药物对肝肾功能等的影响监测。