泌尿系感染的治疗主要依靠药物，一般来说，常用的药物有抗生素等。比如，对于单纯性下尿路感染，通常可以选用呋喃妥因等药物进行治疗。
常用药物种类
抗生素类药物： 常用的有喹诺酮类，像左氧氟沙星等，这类药物能抑制细菌DNA旋转酶，从而发挥杀菌作用。还有头孢菌素类，如头孢克肟，它可以破坏细菌的细胞壁来达到杀菌效果。磺胺类药物： 例如复方新诺明，通过抑制细菌二氢叶酸合成酶，阻止细菌合成叶酸，进而抑制细菌生长繁殖。
治疗的注意事项
疗程要求： 一般单纯性膀胱炎疗程通常为3 - 7天，而肾盂肾炎疗程相对较长，可能需要10 - 14天，要严格按照疗程用药，不能随意停药，否则容易导致感染复发。特殊人群： 孕妇发生泌尿系感染时，用药需谨慎，要选择对胎儿影响小的药物，比如阿莫西林等，必须在医生指导下使用。儿童泌尿系感染用药也需格外注意，要选择儿童适用的剂型，并且严格遵循医生根据体重等计算的用药剂量。
非药物辅助治疗
增加饮水量： 患者每天应保证充足的饮水量，一般建议不少于2000毫升，通过增加排尿量来冲洗尿道，帮助排出细菌等病原体。注意个人卫生： 要保持会阴部清洁，女性要注意经期卫生，同房前后要清洗外生殖器，避免细菌侵入尿道引起感染。
预防复发措施
增强免疫力： 平时要注意加强锻炼，保持良好的生活作息，保证充足的睡眠，饮食上要营养均衡，以提高身体的抵抗力，降低泌尿系感染复发的几率。避免诱因： 尽量避免长时间憋尿，因为憋尿会使尿液在膀胱内停留时间过长，利于细菌繁殖。还要注意避免过度劳累等可能降低身体抵抗力的因素。