判断是否为细菌性痢疾可以从临床表现、流行病学史以及实验室检查等方面入手。一般来说，细菌性痢疾患者通常会有一些典型的表现，比如在发病前1 - 3天可能有不洁饮食史。
临床表现特点
腹泻与腹痛表现：患者往往会出现腹泻症状，每天腹泻次数较多，可能达到十余次甚至更多，大便多为黏液脓血便，同时伴有腹痛，多为左下腹隐痛或阵发性绞痛。全身症状：还可能伴有发热，体温可升高至38℃以上，部分患者会有乏力、食欲减退等全身不适症状。
流行病学史依据
接触史：有食用被志贺菌污染的食物或水的经历，或者与细菌性痢疾患者有密切接触史，比如共同生活、聚餐等情况，这对于判断细菌性痢疾有一定提示作用。
实验室检查支撑
粪便常规检查：显微镜下可见大量白细胞、红细胞，还可能有巨噬细胞。粪便细菌培养：是确诊细菌性痢疾的重要依据，如果粪便中培养出志贺菌，基本可以确诊为细菌性痢疾。一般在粪便采集时要注意尽早采集新鲜粪便，并且要避免污染，这样才能提高培养的阳性率。
与其他疾病的鉴别
与肠炎鉴别：肠炎患者一般大便多为稀水样便，黏液脓血便相对较少见，通过粪便常规和细菌培养等检查可以区分。与阿米巴痢疾鉴别：阿米巴痢疾的粪便多为暗红色果酱样便，粪便中可找到阿米巴滋养体，这与细菌性痢疾的黏液脓血便等表现不同，可通过粪便镜检等进行鉴别。