甲状腺结节的治疗需根据结节性质等因素判断，一般良性结节若无症状通常定期观察，约5%~15%的甲状腺结节为恶性，需手术治疗。
观察随访情况
无症状良性结节：若甲状腺结节是良性且患者无明显不适症状，一般建议每6~12个月复查超声，观察结节大小、形态等变化。比如结节较小，生长缓慢，就可以先通过定期随访监测。儿童与青少年结节：儿童和青少年的甲状腺结节恶性可能性相对较高，所以更要密切随访，一般3~6个月复查一次超声，关注结节变化。
手术治疗情况
恶性结节：如果甲状腺结节经评估考虑为恶性，通常需要手术治疗。比如甲状腺乳头状癌等恶性结节，手术是主要的治疗手段，通过手术切除病变组织。较大良性结节：当甲状腺良性结节较大，产生压迫症状，如压迫气管出现呼吸困难、压迫食管出现吞咽困难等情况时，也需要考虑手术切除结节来缓解症状。
药物辅助情况
伴有甲亢的结节：如果甲状腺结节伴有甲状腺功能亢进，可使用抗甲状腺药物，如甲巯咪唑等，来控制甲状腺激素的分泌，改善甲亢症状，但药物治疗一般是辅助性的，不能根治结节。伴有甲减的结节：若甲状腺结节伴有甲状腺功能减退，可补充甲状腺激素，如左甲状腺素钠片，维持甲状腺功能正常，但这也只是针对甲状腺功能的调整，不是针对结节本身的治疗。