肝性脑病的治疗需要综合多方面措施，一般来说要尽快识别并去除诱因，同时采取药物等治疗手段。例如，对于大部分肝性脑病患者，首先要积极寻找并去除如消化道出血、感染、电解质紊乱等诱因。
药物治疗方面
降氨药物：常用的有L - 鸟氨酸 - L - 门冬氨酸，它可以促进体内氨的代谢，从而降低血氨水平。还有谷氨酸钠或谷氨酸钾等药物，也能与氨结合形成谷氨酰胺，起到降血氨的作用，但使用时需要根据患者电解质情况选择。调节神经递质药物：比如支链氨基酸制剂，肝性脑病患者往往存在支链氨基酸/芳香族氨基酸比例失衡，补充支链氨基酸可以纠正这种失衡，减少假性神经递质的产生。
减少肠道内氨的产生和吸收
乳果糖：它可以酸化肠道，减少肠道内产氨细菌的生长，从而减少氨的产生，还能促进氨的排出。一般成人起始剂量可以是每日30 - 50毫升，分3次口服。乳梨醇：作用与乳果糖类似，也是通过酸化肠道来减少氨的生成和吸收，可用于不能耐受乳果糖的患者，剂量一般为每日30 - 60克，分3次服用。抗生素：如甲硝唑、新霉素等，新霉素可以抑制肠道产尿素酶的细菌，减少氨的生成，但长期使用新霉素可能会引起耳毒性和肾毒性，所以一般不超过1周。
其他治疗措施
调整饮食：急性期应限制蛋白质摄入，给予高碳水化合物饮食，保证热量供应。对于神志清楚的患者，开始数日内限制蛋白质摄入在20克/天以内，病情好转后每3 - 5天增加10克蛋白质，逐渐增加至0.8 - 1.0克/(千克·天)，以植物蛋白为宜。人工肝治疗：对于严重的肝性脑病患者，尤其是肝功能衰竭相关的肝性脑病，人工肝治疗可以清除血液中的毒素，暂时替代肝脏的部分功能。例如，分子吸附再循环系统（MARS）治疗等，能在一定程度上改善患者的病情，但费用相对较高，且有一定的并发症风险。肝移植：对于终末期肝病引起的肝性脑病，肝移植是最有效的治疗手段。但肝移植需要合适的供体，并且手术风险较高，术后还需要长期服用免疫抑制剂等药物。