在月经第二天进行性行为，一般不会怀孕，但可能会对女生身体造成一些影响，具体包括以下几个方面：
1.经期延长：月经期间，女性子宫内膜脱落，此时进行性行为可能会导致子宫收缩，使脱落的子宫内膜无法顺利排出，从而延长经期。
2.感染风险增加：月经期间，女性的宫颈口处于开放状态，此时进行性行为容易将细菌带入子宫，引起感染，如子宫内膜炎、盆腔炎等。
3.子宫内膜异位症：经期同房，还可能导致经血倒流，使子宫内膜碎片种植在子宫以外的部位，从而引发子宫内膜异位症，导致痛经、性交痛等症状。
4.免疫性不孕：经期同房，还可能导致精子抗体产生，从而引起免疫性不孕。
需要注意的是，以上只是一些可能的影响，并不是每个人都会出现。如果女生在经期同房后出现不适症状，应及时就医，以便早发现、早治疗。此外，为了女性的身体健康，建议在经期避免同房。