怀孕初期肚子疼可能是生理性腹痛、先兆流产或宫外孕导致，可采取不同方法治疗。具体如下：
一、生理性腹痛：女性怀孕后子宫会增大，牵扯子宫韧带从而引发腹痛。通常这种腹痛不太严重，发作时间较短，一般无需特殊治疗。
二、先兆流产：胚胎着床不稳定会引起宫缩，孕妇会有腹痛表现，部分孕妇还会伴有小腹坠胀感。如果孕妇出血量不多，需卧床休息，避免剧烈运动；若阴道出血量较大，则要及时到医院进行保胎治疗。
三、宫外孕：受精卵未在子宫内着床，而是在输卵管等部位着床时，随着孕囊增大，会使输卵管膨大甚至破裂，患者会出现腹痛，多为单侧腹痛，也可能有不规则阴道出血。如果孕囊活性差、体积不大且未破裂可保守治疗；若孕囊已破裂，尤其是出现大出血的患者，需进行输卵管切除手术；若患者为年轻女性且有生育要求，可进行输卵管开窗术。
总之，怀孕初期肚子疼的原因多样，应根据具体情况采取相应的治疗措施。如果出现异常腹痛或出血等情况，要及时就医，以便明确原因并进行妥善处理。