甲沟炎可以使用的药物有多种，一般轻度的甲沟炎可以先尝试外用药物。比如碘伏，它可以起到消毒杀菌的作用，每天可以用碘伏棉球擦拭患处2 - 3次。还有莫匹罗星软膏，这是一种抗生素软膏，对于细菌感染引起的甲沟炎有一定的治疗作用，每天涂抹患处2 - 3次。
外用抗菌药物
碘伏： 属于卤素类消毒药，通过使菌体蛋白质变性、死亡来发挥杀菌作用。使用时用棉签蘸取适量碘伏，轻轻涂抹在甲沟炎患处，能帮助清洁创面、预防感染，一般每天涂抹2 - 3次即可。莫匹罗星软膏： 是局部外用抗生素，主要针对革兰阳性球菌引起的皮肤感染。将药膏均匀涂抹在甲沟炎患处，一天涂抹2 - 3次，能抑制细菌生长，缓解炎症。
具有消肿作用的药物
鱼石脂软膏： 有温和的刺激性，可消炎、消肿、促进脓肿局限。把鱼石脂软膏涂抹在甲沟炎红肿部位，能减轻局部的红肿情况，使用时适量涂抹，每天1 - 2次。如意金黄散： 用醋或酒调成糊状后敷在甲沟炎患处，有清热解毒、消肿止痛的功效。根据患处面积大小调配合适的糊状物，敷用后保持湿润，每天可敷2 - 3次。
特殊情况用药注意
如果甲沟炎比较严重，出现明显的化脓、红肿热痛加剧等情况，可能还需要结合口服抗生素。但口服抗生素需要在医生指导下使用，比如头孢类抗生素等。不过儿童、孕妇等特殊人群使用口服抗生素要格外谨慎，儿童一般不建议自行随意使用成人的口服抗生素，孕妇使用抗生素更要严格遵循医生的建议，因为某些抗生素可能会对胎儿产生影响。同时，在使用这些药物期间，如果甲沟炎症状没有改善甚至加重，如红肿范围扩大、出现发热等全身症状，应及时就医，可能需要进行手术等其他治疗方式，而不能仅依靠药物治疗。