脑干受伤后是否会留下后遗症，与受伤的严重程度密切相关。一般来说，轻度脑干受伤部分患者可能不会留下明显后遗症，但中重度脑干受伤患者很可能会有后遗症，比如约30%~50%的中重度脑干损伤患者会长期昏迷。
后遗症的具体表现
认知功能障碍： 可能出现记忆力减退，尤其是近期记忆力下降明显，患者可能记不住刚发生的事情。还可能有注意力不集中的情况，很难长时间专注于某件事情。比如在学习或工作中，不能像以前一样快速吸收知识和完成任务。运动功能障碍： 会导致肢体运动不协调，走路时可能出现蹒跚、摇晃的情况，难以保持平衡。有的患者肢体力量也会减弱，比如上肢抬举困难，不能像正常一样轻松拿起物品。严重的还可能出现肢体瘫痪，影响日常的肢体活动。吞咽功能障碍： 脑干受伤可能影响吞咽反射，导致吞咽困难，容易出现呛咳现象。患者进食时需要特别小心，否则可能引起吸入性肺炎等并发症。有的患者甚至需要通过鼻饲来保证营养摄入。
影响后遗症的因素
受伤程度： 脑干受伤越严重，比如受伤导致脑干组织大面积受损、出血量大等情况，留下后遗症的可能性就越大，而且后遗症往往也更严重。相反，轻度的脑干受伤，如只是轻微的震荡等，相对来说留下严重后遗症的几率较低。治疗时机： 受伤后如果能在黄金时间内（通常是受伤后6小时内）得到有效的救治，比如及时降低颅内压、改善脑部血液循环等，有助于减少脑组织的进一步损伤，从而降低后遗症的发生风险或减轻后遗症的严重程度。如果救治不及时，脑组织受损会持续加重，后遗症发生的可能性和严重程度都会增加。康复治疗情况： 受伤后积极进行康复治疗，如在病情稳定后尽早开展运动康复、认知康复、吞咽康复等训练，能够促进神经功能的恢复，有助于减少后遗症的发生或减轻后遗症的程度。如果没有进行规范有效的康复治疗，患者的功能恢复会受到影响，后遗症可能会更明显。