患灰指甲的治疗方法主要有外用药物、口服药物以及手术拔甲等。一般来说，外用药物治疗相对较温和，而口服药物见效可能更快些，但都需要一定的时间。
外用药物治疗
局部擦药：常用的有阿莫罗芬搽剂，它可以渗透进入甲板，抑制真菌生长。使用时要先将病甲尽量锉薄，然后再涂抹药物，一般每周使用1 - 2次，坚持使用数月可能看到效果。不过，外用药物治疗周期比较长，而且对于较严重的灰指甲可能效果有限。封包削治：可以先把病甲进行封包，让病甲软化后再用刀片慢慢削除病甲，然后再配合外用抗真菌药物。这种方法能让药物更好地渗透到甲下，但操作需要在正规医疗场所由专业人员进行，自己操作容易损伤周围正常组织。
口服药物治疗
抗真菌药物：像伊曲康唑胶囊，它是一种脂溶性药物，需要餐后立即服用，采用冲击疗法，即吃一周停三周为一个疗程，一般需要2 - 3个疗程。还有特比萘芬片，它可以抑制真菌细胞膜的合成来发挥抗真菌作用，每天服用一次，疗程相对伊曲康唑短一些，一般手指甲灰指甲需要服用2 - 3个月，脚趾甲灰指甲可能需要3 - 4个月。不过口服抗真菌药物需要定期监测肝功能，因为这类药物可能对肝脏有一定影响，所以在用药前和用药过程中都要遵医嘱检查肝功能。
手术拔甲治疗
手术操作：对于单发的灰指甲，可以考虑手术拔甲。医生会将病甲拔除，但手术创伤相对较大，术后恢复需要一定时间，而且术后新长出来的指甲也有可能再次被感染，所以现在临床上相对较少采用手术拔甲的方法，更多是作为辅助治疗手段。在治疗灰指甲的过程中，患者要注意保持足部或手部的清洁干燥，勤换鞋袜，避免与他人共用拖鞋、脚盆等物品，防止交叉感染。同时，要按照医生的建议坚持治疗，不要随意中断，因为灰指甲的治疗需要一定的时间才能彻底清除真菌，防止复发。