男性不孕不育因素较多，其中约有10%-15%的育龄夫妇存在不孕不育问题，而男性因素约占一半。
生殖系统疾病因素
先天性生殖系统异常： 像先天性睾丸发育不全综合征，会导致睾丸生精功能障碍，影响精子的产生。还有隐睾症，若睾丸未能正常下降至阴囊，处于腹腔等温度相对较高的部位，会影响精子的生成，因为睾丸需要相对较低的温度才能正常产生精子。后天性生殖系统疾病： 附睾炎、睾丸炎较为常见。附睾炎多由细菌感染引起，炎症会影响附睾的功能，进而影响精子的储存和输送；睾丸炎如果是由腮腺炎病毒引起的流行性腮腺炎并发的，可能会导致睾丸萎缩，严重影响生精功能。前列腺炎也可能对男性生育有影响，前列腺液是精液的重要组成部分，前列腺炎可能会改变精液的成分和理化性质，影响精子的活力和受精能力。
精子质量问题因素
精子数量异常： 少精子症是指精液中的精子数量低于正常范围。一般来说，正常精子密度应大于15×10⁶/ml，低于这个数值就属于少精子症，会降低受孕的概率。无精子症则更为严重，分为梗阻性无精子症和非梗阻性无精子症，梗阻性无精子症是因为输精管道堵塞，精子无法排出；非梗阻性无精子症多与睾丸生精障碍有关。精子活力异常： 弱精子症是指精子的活动能力低下。正常精子活力应达到a级（快速前向运动）精子≥25%，或a+b级（前向运动）精子≥50%，如果低于这个标准，精子难以游动到输卵管与卵子结合，从而影响生育。畸形精子症是指精液中畸形精子的比例过高，畸形精子过多会影响精子的正常功能，降低受精的可能性。
内分泌因素
垂体病变： 垂体是重要的内分泌器官，垂体瘤等垂体病变可能会影响促性腺激素的分泌，促性腺激素对睾丸的生精功能和内分泌功能有重要调节作用，垂体病变导致促性腺激素分泌异常，会影响精子的产生和成熟。甲状腺疾病： 甲状腺功能亢进或减退都会影响男性的生殖功能。甲状腺功能亢进时，甲状腺激素分泌过多，可能会干扰下丘脑 - 垂体 - 睾丸轴的正常调节，导致精子生成减少、活力降低；甲状腺功能减退时，甲状腺激素分泌不足，也会影响性激素的分泌，进而影响生育功能。
不良生活方式因素
吸烟饮酒： 长期大量吸烟的男性，香烟中的尼古丁等有害物质会影响精子的生成和活力，降低精子的质量。过量饮酒会抑制睾丸的生精功能，还可能导致性激素水平异常，影响男性的生殖功能。研究表明，长期吸烟饮酒的男性不孕不育的发生率比正常生活方式的男性要高很多。高温环境影响： 长期处于高温环境中会对精子产生不利影响。比如经常泡温泉、洗桑拿，或者长时间从事高温作业的男性，阴囊局部温度升高，会影响睾丸的生精功能，因为睾丸需要相对低温的环境来维持正常的生精过程，过高的温度会抑制精子的生成。