性行为后三天龟头上出现小红点，可能与以下原因有关。
1.龟头炎：性行为时，龟头与阴道黏膜摩擦，可能导致龟头黏膜受损，细菌感染后引发炎症，出现龟头红点、红斑、疼痛、瘙痒等症状。
2.过敏：对避孕套或性爱过程中使用的润滑剂等过敏，也可能导致龟头出现红点。
3.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。感染后会在龟头、冠状沟等部位出现红斑、水疱，伴有疼痛、瘙痒等症状。
4.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染引起，主要通过性接触传播。初期为淡红色丘疹，逐渐增大增多，形成菜花状、鸡冠状赘生物，表面凹凸不平，易出血。
如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，如分泌物涂片、培养、核酸检测等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持龟头清洁卫生，避免搔抓、摩擦，避免性生活，以免加重病情。此外，在治疗期间，应注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，多喝水，促进炎症消退。如果是过敏引起的，应避免接触过敏原。如果是生殖器疱疹或尖锐湿疣，需要及时治疗，同时性伴侣也应进行检查和治疗，以避免交叉感染。