掏耳朵疼痛可能由多种原因引起。比如用尖锐工具掏耳朵时，可能会损伤外耳道皮肤，导致疼痛。据统计，因不当掏耳导致外耳道损伤就医的情况并不少见。
外耳道皮肤损伤：
指甲或尖锐工具划伤： 用指甲、发夹、火柴棍等尖锐物品掏耳朵，很容易划伤外耳道皮肤，从而引起疼痛。这种损伤通常会有明显的痛感，若划伤较深，可能还会有少量出血。棉签头折断： 使用棉签掏耳朵时，若操作不当，可能会使棉签头折断在外耳道内，也会引发疼痛，还可能伴有耳部异物感。
外耳道炎：
感染性外耳道炎： 细菌、真菌等病原体感染外耳道可引发炎症。比如游泳后耳朵进水，容易滋生细菌，引发外耳道炎，出现掏耳朵疼痛的情况，同时可能伴有耳朵瘙痒、分泌物增多等症状。坏死性外耳道炎： 多见于糖尿病患者等免疫力低下人群，感染较为严重，疼痛往往比较剧烈，还可能伴有发热等全身症状，需要及时治疗。
耵聍栓塞刺激：
当耵聍（耳屎）过多形成栓塞时，掏耳朵会刺激外耳道壁，引起疼痛。尤其是耵聍靠近鼓膜时，掏耳刺激可能会更明显，还可能影响听力，出现耳闷等症状。
耳部其他病变：
外耳道异物： 儿童如果将小珠子、小玩具等异物塞入外耳道，掏耳朵时可能会碰到异物，引起疼痛。成年人也可能会有昆虫等误入外耳道的情况，导致掏耳疼痛。耳部肿瘤： 虽然相对少见，但外耳道、中耳的肿瘤也可能导致掏耳朵时疼痛，这种疼痛可能会逐渐加重，还可能伴有耳部流血、听力下降等异常表现。