新生儿湿疹的引起原因较多，其中遗传因素较为常见，约60%的患儿有家族过敏史，如果父母一方有过敏性疾病，新生儿患湿疹的概率可能达30%左右；皮肤屏障功能不完善也是重要因素，新生儿皮肤薄嫩，保水能力差，经皮水分丢失多，容易受外界刺激引发湿疹；还有环境因素，比如室内温度过高、穿盖过厚，或者接触化纤材质的衣物等，都可能刺激新生儿皮肤，诱发湿疹。
遗传因素方面
家族过敏史影响： 如果父母一方患有过敏性疾病，像过敏性鼻炎、哮喘等，新生儿患湿疹的风险会明显增加，大概有30%左右的概率。比如父亲有过敏性鼻炎，母亲没有，新生儿患湿疹的几率就比正常家庭高。遗传机制： 湿疹与基因有关，某些特定基因的突变会使新生儿更容易出现皮肤免疫调节异常，从而引发湿疹。
皮肤屏障功能不完善方面
皮肤薄嫩特点： 新生儿的皮肤比成年人薄很多，其角质层厚度仅为成人的1/3左右，这样的皮肤保水能力差，经皮水分丢失比成人多3 - 5倍。保水能力不足表现： 皮肤容易处于干燥状态，而干燥的皮肤屏障功能更弱，对外界刺激的抵御能力下降，就容易受到各种因素影响引发湿疹，比如在秋冬季节，室内空气干燥时，新生儿皮肤更容易出现问题。
环境因素方面
温度湿度影响： 室内温度过高，比如超过28℃，或者湿度不合适，像湿度低于30%，都容易让新生儿长湿疹。因为高温高湿环境利于细菌、真菌滋生，还会影响皮肤的正常代谢。衣物材质刺激： 给新生儿穿化纤材质的衣物，化纤材质不透气且容易产生静电，会刺激新生儿娇嫩的皮肤，从而诱发湿疹。比如有些家长给新生儿穿了化纤材质的内衣，没多久新生儿皮肤就出现红疹。