尿分叉常见原因有生理性和病理性两种情况。生理性尿分叉多是暂时现象，比如男性晨起后因尿道内积攒了一定量的精液，可能出现短时间的尿分叉，一般无需特殊处理。而病理性尿分叉可能由以下情况引起：
泌尿系统炎症导致
前列腺炎： 前列腺炎是成年男性常见疾病，当前列腺发生炎症时，会导致前列腺充血、水肿，压迫尿道，从而引起尿分叉。同时还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。例如，有研究发现，约50%的男性在一生中会受到前列腺炎的影响。尿道炎： 尿道炎多由细菌、支原体、衣原体等病原体感染引起。炎症会使尿道黏膜充血、肿胀，甚至出现分泌物，导致尿道狭窄，出现尿分叉。急性尿道炎患者往往起病急，有明显的尿道刺痒、灼痛等症状。
尿道结石或狭窄引发
尿道结石： 尿道内的结石会阻碍尿液的顺利排出，使尿液通过时出现分叉现象。结石可能是肾脏或膀胱内的结石排到尿道中形成的。比如，较小的尿道结石可能会在排尿时引起疼痛，还可能出现血尿。尿道狭窄： 先天性尿道狭窄较为少见，后天性尿道狭窄多与尿道损伤、尿道感染、医源性损伤等有关。尿道狭窄会使尿道腔变窄，尿液通过时就会出现分叉，且排尿会变得费力。
前列腺增生所致
多见于中老年男性。随着年龄增长，前列腺会逐渐增生，增生的前列腺组织会压迫尿道，导致尿道变细、弯曲，进而出现尿分叉。同时还可能有进行性排尿困难、夜尿增多等表现。一般50岁以上男性中，前列腺增生的发生率会逐渐升高，据统计，60岁以上男性约半数有前列腺增生相关症状。