真菌感染的治疗需根据感染部位、真菌种类等因素综合判断。一般来说，抗真菌药物是主要的治疗手段，不同类型的真菌感染可能选用不同的药物。
外用抗真菌药物的应用
皮肤浅表真菌感染：对于一些浅表的皮肤真菌感染，比如体癣、股癣等，常用的外用抗真菌药物有酮康唑乳膏、咪康唑乳膏等。这些药物可以直接作用于感染部位，抑制真菌的生长繁殖。一般每天使用1 - 2次，连续使用几周，具体时间取决于感染的严重程度。例如，轻度的体癣可能使用2 - 4周左右可见效。指甲真菌感染：指甲的真菌感染治疗相对复杂，外用药物治疗时，需要先将病甲尽量修薄，然后再涂抹抗真菌药物，如阿莫罗芬搽剂。通常每周使用1 - 2次，需要连续使用数月，可能3 - 6个月甚至更久才能看到新的健康指甲长出。
口服抗真菌药物的使用
系统性真菌感染：当真菌感染累及身体内部组织，如肺部、消化道等时，可能需要口服抗真菌药物。常见的有伊曲康唑、氟康唑等。伊曲康唑对于一些深部真菌感染有较好的疗效，氟康唑可用于念珠菌感染等情况。例如，治疗念珠菌性食管炎时，氟康唑可能需要服用数周时间。但这类药物使用时需要注意药物的相互作用以及对肝肾功能的影响，用药期间可能需要定期监测肝肾功能。免疫低下人群的真菌感染：对于免疫低下的患者，如艾滋病患者合并真菌感染时，治疗往往需要更强效的抗真菌药物，并且治疗疗程可能较长。此时可能需要根据真菌培养和药敏结果来选择合适的药物，以提高治疗效果。
不同部位真菌感染的治疗差异
肺部真菌感染：肺部真菌感染的治疗相对困难，需要根据真菌种类选择合适的药物。如果是曲霉菌感染，可能会用到伏立康唑等药物。治疗周期通常比较长，可能需要数周甚至数月，同时还需要关注患者的免疫状态，积极调整患者的免疫功能，比如对于艾滋病患者要进行抗病毒治疗等综合措施来辅助肺部真菌感染的治疗。阴道真菌感染：阴道真菌感染（如外阴阴道假丝酵母菌病）常用局部用药结合口服药的方式。局部可使用克霉唑栓剂等，口服药可选用氟康唑等。一般局部用药时，每晚一枚栓剂，连用3日左右；口服氟康唑通常一次服用即可，但如果病情容易复发，可能需要调整用药方案。同时，患者在治疗期间要注意个人卫生，保持外阴清洁干燥，避免性生活等。