肩上长痘痘主要和一些皮肤疾病相关，常见的有毛囊炎、扁平疣、痤疮、寻常疣等，具体原因需结合相应伴随症状到医院确诊才能准确判断。
一、毛囊炎：
肩上长痘痘，颜色发红，伴有疼痛、瘙痒等症状，痘痘中心有白尖，通常考虑是毛囊炎，这是一种由细菌感染导致的毛囊感染性疾病。常见致病菌包括金黄色葡萄球菌、革兰阴性菌以及马拉色菌等。
二、扁平疣：
若痘痘接近正常皮肤颜色或痘痘表面光滑呈褐色，且无疼痛、瘙痒等症状，那就可能是病毒感染引发的扁平疣。这种皮肤疾病好发于面部、四肢、肩部等部位，可通过直接或间接接触传播。为切断传播途径，患者要注意将自己的贴身衣服与他人分开，不与他人共用生活物品。
三、痤疮：
多发于青春期的男性或女性，主要发病部位集中在面部、胸部、背部等皮脂腺分泌旺盛的区域，以粉刺、丘疹或脓包等为主要症状表现。
四、寻常疣：
主要是由于感染人乳头瘤病毒而引起的一种良性增生性疾病，可发生在身体任何部位的肌肤，主要表现为实质性丘疹，皮损表面粗糙，一般不会引起自觉症状，但用手触摸会有明显压痛感。
总之，肩上长痘痘可能是多种皮肤疾病的表现，需要根据具体症状来判断，必要时应及时就医诊断。