通常来说，孕妇长痔疮且有肉球很痛时，可按医嘱通过以下几种方式来治疗。
一、使用药物：孕妇长痔疮有肉球很痛，可遵医嘱使用一些具有清热解毒、止血、止痛等功效的药物来治疗，比如痔速宁片，其主要成分包括白蔹、槐花、五倍子、黑豆等，能起到解毒消炎、止血止痛、退肿通便等作用，从而有助于缓解痔疮症状；痔炎消胶囊，主要含有火麻仁、紫珠叶、槐花、金银花等成分，有清热解毒、润肠通便、止血止痛等功效；三七化痔丸，成分包含盐肤木、岗稔子、勒苋菜等，具有清热解毒、止血止痛等效果。
二、手术治疗：如果孕妇长痔疮有肉球很痛的情况持续发展，那么孕妇可在分娩后通过多种手术方式进行治疗，如痔单纯切除术，这是治疗外痔或混合痔的常用手术方法，通过切除痔核来达到治疗目的；吻合器痔上黏膜环切钉合术，适用于严重内痔、部分直肠黏膜脱垂的患者；血栓外痔剥离术，主要用于治疗血栓性外痔。
三、日常护理：在日常生活中，孕妇需要多喝热水，饮食以清淡易消化为主，如小米粥、软面条、藕粉等。还应适当进行运动，如散步、做操、打太极等。平时穿着要宽松、舒适，可选择棉质衣物。家人可以用冷毛巾轻敷孕妇的患处，这能够起到缓解疼痛的作用。
总之，孕妇长痔疮且有肉球很痛时，可通过上述方式来进行相应的治疗和护理。