子宫内膜增生主要与体内雌激素水平异常有关。长期无孕激素拮抗的雌激素刺激是常见原因之一，比如一些患有多囊卵巢综合征的女性，约有30%~50%存在子宫内膜增生的情况，就是因为体内雌激素持续分泌，却缺乏孕激素来对抗。
一、内分泌失调因素
无排卵情况： 青春期女孩和围绝经期女性容易出现无排卵现象。青春期女孩下丘脑 - 垂体 - 卵巢轴尚未完全成熟，围绝经期女性卵巢功能衰退，都可能导致不排卵，进而使子宫内膜长期受雌激素单一刺激，缺乏孕激素转化，引发增生。比如青春期女孩可能连续几个月不来月经，之后大量出血，检查就可能发现子宫内膜增生。肥胖因素： 肥胖女性体内脂肪较多，脂肪会将雄激素转化为雌激素，使体内雌激素水平升高。有研究显示，肥胖女性患子宫内膜增生的风险比正常体重女性高约3倍。例如，体重指数（BMI）大于30的肥胖女性，子宫内膜增生的发生率明显增加。
二、外源性雌激素影响
长期服用雌激素药物： 一些患有子宫肌瘤等疾病需要长期服用雌激素类药物的女性，如果没有同时补充孕激素，就容易引起子宫内膜增生。比如因子宫肌瘤长期服用戊酸雌二醇片的女性，就有较高的子宫内膜增生风险。使用含有雌激素的保健品： 部分女性为了美容等目的长期服用含有雌激素的保健品，也会使体内雌激素水平升高，刺激子宫内膜增生。比如长期服用含有大豆异黄酮等成分保健品的女性，就可能面临子宫内膜增生的问题。
三、疾病相关因素
多囊卵巢综合征： 除了前面提到的无排卵导致雌激素刺激外，多囊卵巢综合征患者往往还存在胰岛素抵抗等问题，进一步影响激素代谢，加重子宫内膜受雌激素刺激的状况，约有半数多囊卵巢综合征患者伴有子宫内膜增生。内分泌功能性肿瘤： 如卵巢颗粒细胞瘤等内分泌功能性肿瘤，会持续分泌雌激素，使子宫内膜长期处于受雌激素刺激的状态，从而引发子宫内膜增生。这类肿瘤相对较少见，但一旦发生，对子宫内膜的影响较为明显。