病毒性结膜炎通常可通过局部用药等方式治疗，一般使用抗病毒滴眼液等药物。例如更昔洛韦滴眼液就可用于治疗病毒性结膜炎。
局部药物治疗
抗病毒滴眼液：常用的有阿昔洛韦滴眼液，它能抑制病毒DNA多聚酶，阻止病毒复制，对单纯疱疹病毒性结膜炎等有较好疗效。还有更昔洛韦眼用凝胶，也可用于治疗病毒性结膜炎，能在眼部发挥抗病毒作用。干扰素制剂：如重组人干扰素α-2b滴眼液，可调节免疫功能，增强机体抗病毒能力，帮助对抗病毒性结膜炎。
一般护理注意事项
眼部清洁：患者要注意眼部卫生，可用生理盐水等清洁眼部，清除眼部分泌物，但要注意动作轻柔，避免损伤眼部。一般每天可清洁1 - 2次。避免交叉感染：病毒性结膜炎具有传染性，患者要避免与他人共用毛巾、手帕等物品，防止将病毒传染给他人。同时，患病期间尽量不要去公共场所，如游泳池等。
特殊人群需注意
儿童患者：儿童患病毒性结膜炎时，使用滴眼液要格外小心，需在成人监护下使用。要选择适合儿童的低浓度、温和的抗病毒滴眼液，且要避免儿童揉眼，防止加重病情或导致感染扩散。孕妇患者：孕妇患病毒性结膜炎时，用药需谨慎。应在医生评估后选择相对安全的局部用药，避免使用可能对胎儿有影响的药物。要遵循医生的指导进行治疗和护理。