早上起来咳嗽有黄痰，可能是由支气管炎、肺炎、肺脓肿等疾病引发。
一、支气管炎：它是因生物、理化刺激或过敏等各类因素导致的气管、支气管黏膜及其周围组织的炎症。典型表现为咳嗽和咳痰，起初痰量较少，之后会逐渐增多，且可能持续2至3周。通常痰液为白色黏痰，若合并细菌感染，比如铜绿假单胞菌感染，痰液颜色会转变为黄绿色。
二、肺炎：指的是终末气道、肺泡和肺间质的炎症。可由病原微生物、物理化学因素、免疫损伤、过敏以及药物诱发，其症状轻重不一，取决于病因与身体状况。咳痰一般在咳嗽出现后产生，开始表现为痰液增多，常为白色黏液痰，一旦合并铜绿假单胞菌感染，痰液颜色也会变为黄绿色。
三、肺脓肿：这是一种或多种病原体引起的肺部化脓性病症，痰液可为黏液痰、黏液脓痰，要是由铜绿假单胞菌感染所致，同样会使痰液颜色变为黄绿色。
若患者早上起来有咳嗽且伴有黄痰的情况，建议不必过度紧张焦虑，应及时就诊，完善相关检查以明确诊断，并积极开展治疗。