肾结石患者在排尿时尿道口有刺痛感，可能有以下原因：一是肾结石移动刺激肾部黏膜；二是出现了细菌感染。对此，患者需前往泌尿外科进行尿常规、泌尿系统彩超等检查，明确诊断后可服用抗生素药物治疗。
一、若患者有肾结石且排尿后尿道口出现烧灼痛，这可能表明肾结石活动刺激肾黏膜导致肾黏膜出血，黏膜损伤后局部有炎症刺激，使得排尿时刺激尿道，进而引起尿道灼痛，这主要与黏膜损伤引发的炎症和血尿相关。
1.这种情况下，患者可以进行尿常规检查，若尿常规检查可见白细胞或尿常规细菌严重超标，即可诊断为结石合并泌尿系统感染。
2.患者可选择喹诺酮类抗生素进行治疗，比如环丙沙星片、左氧氟沙星胶囊等。对于过敏患者，可口服头孢菌素类药物治疗，如头孢克肟胶囊。
二、也有可能是因为结石合并细菌感染，导致携带细菌的尿液通过输尿管从肾盂进入膀胱，从而引起尿路细菌感染，使患者排尿时尿道口出现刺痛感。
总之，肾结石患者出现排尿时尿道口刺痛的情况，需要及时就医检查并明确原因，以便采取针对性的治疗措施。