拉肚子的原因有多种，比如感染性因素就较为常见，像细菌感染引发的急性肠胃炎，大约有10%-20%的腹泻是由细菌感染导致，常见的细菌有大肠杆菌等；病毒感染也是重要原因，轮状病毒感染多见于儿童，在秋冬季节高发，会引起小儿腹泻。
感染性因素
细菌感染： 除了大肠杆菌，沙门氏菌感染也会导致拉肚子，患者可能会出现腹痛、腹泻、发热等症状，严重时可能会脱水。例如进食了被沙门氏菌污染的食物，就容易引发感染性腹泻。病毒感染： 除轮状病毒外，诺如病毒也是常见的导致拉肚子的病毒，它具有很强的传染性，常通过污染的水源、食物传播，会引起成人和儿童的急性胃肠炎，表现为呕吐、腹泻、恶心等症状。
非感染性因素
饮食因素： 食用过多生冷食物容易引起拉肚子，比如夏天大量吃冰镇西瓜，可能会刺激胃肠道，导致胃肠蠕动加快而腹泻。还有食物过敏也会导致拉肚子，有些人对牛奶中的乳糖不耐受，喝了牛奶后就会出现腹泻、腹胀等症状。疾病因素： 一些消化系统疾病会引发拉肚子，比如肠易激综合征，这是一种常见的功能性胃肠病，患者会出现腹痛、腹泻或便秘等症状，精神紧张、焦虑等情绪因素可能会诱发或加重病情。甲状腺功能亢进症患者，由于甲状腺激素分泌过多，会加快胃肠蠕动，也可能出现拉肚子的情况。