睾丸不舒服时可通过服用抗菌药物、抗病毒药物或止痛药物来治疗。
一、抗菌药物：如果是细菌感染引发睾丸炎或附睾炎，导致睾丸不适，除了用热毛巾热敷外，还需遵医嘱口服头孢克肟胶囊、头孢拉定胶囊等药物。这些抗菌药物能有效对抗细菌感染，缓解炎症。
二、抗病毒药物：当感染腮腺病毒而使睾丸受到刺激时，就需要选择抗病毒药物进行治疗，比如利巴韦林胶囊，它能帮助抑制病毒，减轻对睾丸的不良影响。
三、止痛药物：要是睾丸疼痛非常严重或者伴有高热，就需要口服对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等止痛药物来缓解症状。
以上是常见的用于治疗睾丸不舒服的药物，在用药时，务必严格遵循医生的指导。一旦出现严重症状，要及时就医。
总之，睾丸不舒服时要根据具体病因选择合适的药物治疗，同时要遵医嘱用药，注意观察症状变化，如有异常及时处理。