哺乳期患有咽喉炎时，可以在医生的指导下选择以下药物：
1.青霉素类：如阿莫西林，对母婴影响较小，是较安全的选择。
2.头孢菌素类：如头孢呋辛酯，也相对较为安全。
3.清热解毒的中药：具有清热解毒、利咽止痛功效的中药，如双黄连口服液、清开灵颗粒等，在医生的指导下使用。
需要注意的是，在使用任何药物之前，都应该先咨询医生或药师，以确保药物对哺乳期婴儿的安全性。同时，还可以采取以下措施来缓解咽喉炎的症状：
1.多喝水：保持身体水分充足，有助于缓解喉咙疼痛。
2.盐水漱口：用温盐水漱口可以减轻喉咙炎症。
3.避免刺激性食物：少吃辛辣、油腻、酸性食物，以及咖啡、茶等刺激性饮料。
4.注意休息：充足的休息有助于身体恢复。
5.保持室内空气湿润：使用加湿器可以缓解喉咙干燥。
如果症状持续不缓解或加重，应及时就医。此外，在哺乳期，妈妈应注意个人卫生，勤洗手，避免将细菌传染给宝宝。