甲状腺结节消失较为少见，一般可通过手术治疗使部分结节消失，比如对于一些较大且有恶变倾向的甲状腺结节，手术切除后结节就消失了。但多数甲状腺结节需长期观察，以下是相关情况：
手术治疗让部分结节消失
甲状腺良性结节较大时： 当甲状腺良性结节直径超过4厘米，可能会产生压迫症状，如压迫气管导致呼吸困难等，此时手术切除是让结节消失的有效方式。医生会根据结节的具体情况选择合适的手术方式，如甲状腺腺叶切除术等。甲状腺恶性结节： 对于甲状腺恶性结节，手术是主要的治疗手段之一，通过手术切除病变组织，可使甲状腺结节消失，术后可能还需要结合放疗、化疗等进一步治疗。
定期观察部分结节可能无变化或缩小
良性小结节： 对于一些体积较小的良性甲状腺结节，如直径小于1厘米的纯囊性结节或部分边界清晰、血流不丰富的良性结节，可定期（一般3~6个月）进行甲状腺超声检查观察。部分结节可能长期无明显变化，也有少数可能会缓慢缩小，但完全消失的情况较少见。炎症性结节： 由甲状腺炎引起的结节，如亚急性甲状腺炎导致的甲状腺结节，在炎症控制后，部分结节可能会缩小，但也不一定能完全消失，需要密切监测甲状腺功能和结节变化。
药物治疗对部分结节有一定作用
甲状腺功能亢进伴发的结节： 如果甲状腺结节是由甲状腺功能亢进引起，可使用抗甲状腺药物，如甲巯咪唑等。通过控制甲状腺功能亢进，部分患者的甲状腺结节可能会有所缩小，但完全消失比较困难，一般需要长期服药控制甲状腺功能，同时定期复查结节情况。甲状腺功能减退伴发的结节： 对于甲状腺功能减退伴发的结节，可补充左甲状腺素钠片治疗甲状腺功能减退，在甲状腺功能恢复正常后，部分结节可能会有一定变化，但也不能保证结节消失，同样需要定期监测。