一般来说，检查免疫系统全套主要在于检查细胞免疫和体液免疫的功能。具体如下：
一、细胞免疫：
1.T细胞亚群的检测：
T细胞亚群降低可见于免疫缺陷性疾病，比如艾滋病；T细胞亚群升高则常见于甲状腺功能亢进症。同时还包括B细胞分化抗原检测。
2.细胞因子检测。
3.自然杀伤细胞的免疫检测。
4.肿瘤标志物检测，如：
(1)甲胎蛋白检测。
(2)癌胚抗原检测。
(3)组织多肽抗原检测。
二、体液免疫：
1.免疫球蛋白：
免疫球蛋白G升高常见于各种慢性感染、慢性肝病等；降低常见于各种先天性和获得性体液免疫缺陷病、肾病综合征等。
免疫球蛋白A增高见于类风湿性关节炎、肝硬化等，降低常见于反复的呼吸道感染。
2.血清总补体活性测定：血清总补体活性升高可在急性炎症、组织损伤和某些恶性肿瘤中见到，而血清总补体活性降低可见于肾小球肾炎等。
总之，具体免疫系统检查项目的选择要依据患者的疾病情况来确定。