生理性和病理性卵巢囊肿分别指非功能性和功能性卵巢囊肿，判断方法包括临床症状、影像学检查、实验室检查等。
一、临床症状
1.功能性卵巢囊肿：常见的如滤泡囊肿、黄体囊肿等多与月经周期有一定关联，患者通常无显著不适表现，部分可能在2至3个月内自行消退。
2.非功能性卵巢囊肿：患者可能出现局部隐痛、小腹下坠感、下腹部压迫感、性交痛等症状，若发生蒂扭转等并发症，还可能有下腹部剧烈腹痛、头晕、休克等现象。
二、影像学检查
1.盆腔超声检查：可直观观测卵巢囊肿，功能性卵巢囊肿一般体积较小且位于单侧，囊壁光滑，囊腔内可能存在液性暗区。
2.腹腔镜检查：非功能性卵巢囊肿体积相对较大，可能呈囊实性，或双侧均有囊肿，囊壁较粗糙。
三、实验室检查
通过抽血检测肿瘤标志物来分辨卵巢囊肿性质，鉴别功能性卵巢囊肿与病理性卵巢癌，常用的有CA125、CA199等。
总之，可综合利用这些方法来有效区分生理性和病理性卵巢囊肿。