扁桃发炎时，常用的药物有抗生素类和清热解毒类等。一般来说，细菌感染引起的扁桃发炎，使用抗生素治疗较为有效，比如青霉素类或头孢类抗生素等，通常用药后数天内症状会有所缓解。
抗生素类药物
青霉素类： 如果对青霉素不过敏，青霉素是常用的选择。它通过抑制细菌细胞壁的合成发挥杀菌作用，能有效对抗引起扁桃发炎的常见细菌。不过，使用前必须做青霉素皮试，阳性者不能使用。头孢类： 头孢菌素类药物也常用于扁桃发炎的治疗，像头孢拉定等。这类药物抗菌谱较广，对多种引起扁桃发炎的细菌有抑制作用。但同样要注意过敏问题，有头孢类药物过敏史者禁用。
清热解毒类药物
中成药： 有不少清热解毒的中成药可用于扁桃发炎，比如蓝芩口服液。它能起到清热解毒、利咽消肿的作用，对于扁桃发炎引起的咽痛等症状有一定的缓解效果。还有双黄连口服液，也具有清热解毒的功效，可辅助治疗扁桃发炎。不过，服用这类中成药时要注意，不要同时服用滋补性中药，以免影响药效。
局部用药
含漱液： 可以使用复方硼砂含漱液，它能清洁口腔、杀菌消炎，有助于缓解扁桃发炎引起的局部不适。用含漱液时，要按照说明书正确使用，含漱后不要马上饮水。含片： 比如西瓜霜含片，含服后能起到消肿止痛、清喉利咽的作用，能减轻扁桃发炎导致的咽喉疼痛等症状。但要注意，含服含片时不要同时吃其他东西，以免影响药效。
特殊人群用药注意
儿童： 儿童患扁桃发炎用药需谨慎，抗生素的使用要在医生指导下根据体重等情况选择合适的剂量和品种。比如儿童用头孢类药物，要选择适合儿童的剂型，且严格按照医嘱服用。孕妇： 孕妇出现扁桃发炎时用药更要小心，一些药物可能会对胎儿产生影响。抗生素的选择要权衡利弊，尽量选择对胎儿影响小的药物，清热解毒类药物也需在医生评估后使用。