药流多久能排出孕囊取决于患者自身状况，通常来说，一般需要3至6个小时左右可排出孕囊。
一、进行药流时，多数患者需服用米非司酮和米索前列醇。在用药前必须进行B超检查：
1.确定孕囊位置是否在宫内，只有确定在宫内才能服用药物。
2.一般用药后3至6小时左右会排出孕囊。
3.排孕囊过程中患者会有腹痛、阴道出血等现象。
二、对于药流的女性在排孕囊时会伴有大便意向，此时可以用盆接着，并留意观察孕囊情况：
1.选择药流的患者要关注孕囊排出情况。
2.可以在孕囊排出后进行B超检查，查看是否有残留物等情况。
三、药流后要注意多休息，并且在药流后一个月内禁止同房。
总之，药流过程需要密切关注各个方面，从用药前检查到孕囊排出后的后续处理都非常重要，以确保药流的安全和效果。