植物神经紊乱的药物治疗需根据具体症状来选择，一般来说，调节植物神经功能的药物有谷维素，它通常可以调节自主神经功能，常用剂量为一次10 - 30毫克，一日3次。
调节神经递质类药物
5 - 羟色胺再摄取抑制剂：像帕罗西汀等药物，可影响5 - 羟色胺神经递质的再摄取，从而改善植物神经紊乱相关的情绪等症状，但使用时要注意可能出现胃肠道不适等不良反应，且需在医生指导下使用。苯二氮䓬类药物：例如地西泮，有镇静安神的作用，能缓解植物神经紊乱引起的焦虑、失眠等症状，但长期使用可能会成瘾，所以不能擅自长期大量服用。
营养神经类药物
维生素B族：维生素B1、维生素B12等都属于营养神经的药物。维生素B1一般可以一次10毫克，一日3次，它参与神经组织中糖类代谢等过程，对神经的修复有一定帮助；维生素B12能促进神经系统的发育和维持神经纤维的完整性，可通过肌肉注射等方式给药，具体使用需遵医嘱。
针对特定症状的药物
失眠相关药物：如果植物神经紊乱导致严重失眠，除了前面提到的苯二氮䓬类药物，还可以考虑佐匹克隆等药物，佐匹克隆能缩短入睡时间，提高睡眠质量，但同样要注意其可能的不良反应及使用禁忌。心慌等心血管相关症状药物：当植物神经紊乱引起心慌等心血管症状时，若排除了器质性心脏病，可能会用到普萘洛尔等β受体阻滞剂，不过这类药物有一定的禁忌证，比如哮喘患者禁用等，使用前需医生评估患者情况。需要注意的是，植物神经紊乱的药物治疗要在医生的综合评估下进行，因为每个人的病情不同，用药方案也会有所差异，而且药物都有一定的副作用风险，不能自行随意用药。同时，除了药物治疗，还可以结合心理疏导等非药物治疗方法来综合改善植物神经紊乱的状况。