月经结束的第二天同房有可能怀孕，但几率较小。月经是伴随卵巢周期性变化出现的子宫内膜周期性脱落及出血，规律月经的出现是生殖功能成熟的重要标志，是生育期妇女重要的生理现象，具有周期性和自限性。
一、子宫内膜情况：月经后子宫内膜刚形成，不利于受精卵着床。
1.月经刚结束时，子宫内膜处于修复阶段，尚未完全准备好接受受精卵。
(1)此时的内膜厚度和状态不太适合胚胎植入和发育。
(2)这在一定程度上降低了受孕的可能性。
二、排卵可能性：月经刚干净时排卵的可能性不大，但也不能完全排除。
1.一般来说，排卵通常发生在下次月经前的一段时间。
(1)但女性的排卵可能会因各种因素而出现提前或推后。
(2)所以不能绝对保证此时不会排卵。
如果暂时没有要孩子的打算，可以采取安全有效的避孕措施，如服用短效避孕药或男性使用避孕套等。若发现怀孕，应及时去医院检查，咨询医生并遵从医嘱，同时保持心情愉悦。
总之，月经结束第二天同房有怀孕可能，要根据自身情况选择合适的避孕方式，怀孕后要及时就医处理。