癌胚抗原定量偏高可能由多种原因引起。一般来说，一些良性疾病可能导致癌胚抗原定量轻度偏高，比如吸烟者中约有30%的人癌胚抗原会轻度升高，另外，像结肠炎、胰腺炎、肝脏疾病等良性病症，也可能出现癌胚抗原定量稍高的情况，但通常升高幅度不大，多在几十以内。
恶性肿瘤相关原因
消化道肿瘤： 结肠癌、直肠癌等消化道恶性肿瘤常常会引起癌胚抗原定量明显偏高。比如结肠癌患者中，有相当一部分人的癌胚抗原会显著升高，可能超过正常参考值数倍甚至更高。肺癌等其他肿瘤： 肺癌患者的癌胚抗原定量也可能升高，不过升高幅度不如消化道肿瘤那么典型，但也有一定比例的患者会出现该指标异常增高的情况。
生理因素影响
年龄与性别： 一般来说，成年人的癌胚抗原定量正常参考值有一定范围，但随着年龄增长，部分人的指标可能会有轻微变化。而在性别方面，通常没有明显的性别特异性导致癌胚抗原定量偏高，但个体差异存在。妊娠阶段： 女性在妊娠期间，癌胚抗原定量也可能出现偏高的情况，一般在分娩后会逐渐恢复到正常范围。
检测误差等因素
检测方法差异： 不同的检测方法可能会导致癌胚抗原定量结果有一定波动。如果检测过程中操作不规范或者实验室的检测标准有差异，都可能出现假阳性的情况，也就是看似癌胚抗原定量偏高，但实际上并非真实的体内癌胚抗原水平异常。标本采集问题： 比如标本采集时受到污染、保存不当等，也可能影响癌胚抗原定量的检测结果，导致出现偏高的假象。