葡萄球菌感染的症状因感染部位不同而有所差异。一般来说，皮肤软组织感染时，局部可能出现红、肿、热、痛，严重的会有化脓现象；肺部感染时，可能出现发热、咳嗽、咳痰等症状，体温可高达38℃以上；泌尿系统感染时，会有尿频、尿急、尿痛等表现。
皮肤软组织葡萄球菌感染症状
局部红肿热痛： 感染部位的皮肤会发红，温度比周围正常皮肤高，有肿胀感，并且按压时疼痛明显。比如手指被葡萄球菌感染，手指会迅速红肿，触碰就疼。化脓表现： 随着感染加重，局部可能形成脓肿，能摸到波动感，皮肤表面可能会出现黄白色的脓头。
肺部葡萄球菌感染症状
发热情况： 患者通常会出现高热，体温可达39℃ - 40℃，而且发热持续时间较长，可能持续数天不退。呼吸道症状： 有咳嗽症状，多为脓性痰，严重时痰中可能带血。还会有呼吸急促的表现，感觉喘气费劲。
泌尿系统葡萄球菌感染症状
尿路刺激征： 尿频是指排尿次数明显增多，一天可能排尿十几次甚至更多；尿急就是有尿意时很难控制，马上就要排尿；尿痛是排尿时尿道有灼热样疼痛或刺痛感。尿液异常： 尿液外观可能浑浊，还可能出现血尿，尿液中能看到血色。
血液葡萄球菌感染（败血症）症状
全身中毒表现： 患者会有寒战，突然感觉怕冷，接着体温迅速上升。还会出现乏力、精神萎靡等情况，严重时会影响意识，出现烦躁不安甚至昏迷。皮肤表现： 可能出现瘀点，皮肤上有小的出血点，压之不褪色。