祛痘可以选择的药物有很多，像过氧苯甲酰凝胶就比较常用，它可以缓慢释放出新生态氧和苯甲酸，有杀灭痤疮丙酸杆菌、抗炎的作用，一般用药后数周可见效。
外用抗生素类药物
克林霉素磷酸酯凝胶： 主要针对革兰阳性菌，能抑制细菌蛋白质的合成，从而起到抗菌作用，适用于炎性丘疹、脓疱等炎性痤疮的治疗。但对克林霉素过敏者禁用。红霉素软膏： 对大多数革兰阳性菌、部分革兰阴性菌及一些非典型致病菌如衣原体、支原体均有抗菌活性。可用于脓疱疮等化脓性皮肤病、小面积烧伤、溃疡面的感染和寻常痤疮。使用时注意避免接触眼睛及其他黏膜（如口、鼻等），孕妇及哺乳期妇女应在医师指导下使用。
维A酸类药物
阿达帕林凝胶： 属于第三代维A酸类药物，可调节表皮角质形成细胞的分化，使毛囊上皮细胞正常分化，减少微粉刺形成。一般需要连续使用8 - 12周才能看到明显效果。使用时要注意避光，最好在晚间睡前使用，且初始使用时可能会出现轻度刺激反应，如局部红斑、脱屑等，随着使用时间延长会逐渐耐受。异维A酸凝胶： 适用于重度且对其他治疗方法（如系统用康生物制剂等）无效的聚合性痤疮或结节囊肿性痤疮。但本药有致畸作用，育龄期男女服药期间及停药后3个月内应严格避孕，孕妇及哺乳期妇女禁用。
过氧化苯甲酰类药物
除了前面提到的过氧苯甲酰凝胶，它还能缓慢释放新生态氧和苯甲酸，可杀灭痤疮丙酸杆菌，且能轻度剥脱及溶解粉刺。使用时可能会引起皮肤干燥、脱屑及刺激反应，皮肤敏感者要慎用。