阴茎根部长了一个小脓包，可能是以下原因引起：
1.毛囊炎：由于局部皮肤受到细菌感染，可出现以毛囊为中心的红色丘疹，有时顶部会出现脓疱。脓疱破裂后，可排出少量脓液和血性分泌物，伴有疼痛和瘙痒感。可在医生的指导下外用莫匹罗星软膏、夫西地酸乳膏等药物，或口服阿莫西林胶囊、头孢呋辛酯片等抗生素进行治疗。
2.疖肿：是一种发生于毛囊深部及周围组织的化脓性炎症，可由多个疖融合而成，好发于头面部、颈部和臀部等。初起时为毛囊性炎性丘疹，逐渐增大形成红色硬性结节，伴有疼痛。数日后，结节中央会变软，出现波动感，顶部出现黄白色点状脓栓，脓栓脱落可排出脓液和脓血，随后逐渐愈合。可外用鱼石脂软膏、金黄散软膏等药物，或口服头孢氨苄胶囊、头孢拉定胶囊等抗生素进行治疗。
3.皮脂腺囊肿：由于皮脂腺排泄管阻塞，皮脂腺囊状上皮被逐渐增多的内容物膨胀所形成的潴留性囊肿，可发生于任何年龄，但以青壮年多见。囊肿呈圆形，位于皮内，并向皮肤表面突出，囊壁与皮肤紧密粘连，中央可有一个小黑点。如果继发感染，可出现红肿、疼痛等症状。一般需要手术切除，以达到彻底治疗的目的。
4.生殖器疱疹：是由单纯疱疹病毒（HSV）感染泌尿生殖器及肛周皮肤黏膜而引起的一种炎症性水疱性疾病，主要通过性接触传播。潜伏期一般为2-14天，平均为3-5天。初起时局部皮肤会出现烧灼感，随后出现红斑，红斑基础上会出现簇集或散在的小水疱，疱液澄清，疱壁薄且易破，数日后水疱可干涸、结痂，伴有疼痛、瘙痒等症状。可在医生的指导下口服阿昔洛韦片、泛昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。
5.梅毒：是由梅毒螺旋体感染引起的一种慢性全身性传染病，主要通过性接触传播。一期梅毒主要表现为硬下疳，多发生在不洁性行为后2-4周，好发于外生殖器部位，表现为圆形或椭圆形的溃疡，边界清楚，边缘隆起，疮面较清洁，触诊时有软骨样硬度。二期梅毒可出现梅毒疹，表现为红色或红褐色的斑疹或丘疹，可遍布全身，不疼不痒。三期梅毒可出现皮肤、黏膜、骨骼、眼、心血管、神经系统等多系统损害。如果怀疑自己感染了梅毒，应及时到医院进行检查和治疗。
6.尖锐湿疣：是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的一种性传播疾病，主要通过性接触传播。潜伏期一般为1-8个月，平均为3个月。初起时为单个或多个淡红色的小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，逐渐增大、增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。疣体表面容易发生糜烂，有渗液、浸渍及破溃，可伴有瘙痒、疼痛等症状。可在医生的指导下外用咪喹莫特乳膏、鬼臼毒素酊等药物，或口服盐酸伐昔洛韦片、泛昔洛韦片等抗病毒药物进行治疗。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据患者的症状、体征、实验室检查等综合判断。如果阴茎根部长了一个小脓包，建议及时就医，明确诊断，并在医生的指导下进行治疗。同时，要注意个人卫生，保持局部清洁干燥，避免搔抓和挤压，以免加重病情。在治疗期间，应避免性生活，以免传染给他人。