小孩反复高烧的原因有多种。一般来说，小孩反复高烧多是由感染性因素和非感染性因素导致。比如感染性因素中，病毒感染较为常见，像流感病毒引起的流感，就可能让小孩反复高烧3 - 5天左右；细菌感染也会引发，如肺炎链球菌导致的肺炎，也常出现反复高烧情况。
感染性因素导致
病毒感染：
上呼吸道病毒感染： 像普通感冒病毒感染，除了反复高烧外，还常伴有咳嗽、流涕等症状。例如鼻病毒引起的感冒，小孩体温可能会波动在38.5℃ - 39℃左右，持续几天反复。肠道病毒感染： 如EV71肠道病毒引起的手足口病，除了反复高烧，还会在口腔、手部、足部出现疱疹。
细菌感染：
肺炎链球菌感染： 引发肺炎时，小孩除了反复高烧，还会有咳嗽、咳痰，严重的可能呼吸急促。体温可高达39℃以上，持续不退。化脓性链球菌感染： 引起扁桃体炎时，小孩会出现反复高烧，扁桃体红肿、化脓，还可能伴有咽痛、吞咽困难。
非感染性因素导致
自身免疫性疾病：
幼年特发性关节炎： 这是儿童时期常见的自身免疫性疾病，会出现反复高烧，同时伴有关节肿胀、疼痛，活动受限。一般体温波动在38℃ - 40℃之间，时高时低。
结缔组织病：
川崎病： 多见于5岁以下儿童，主要表现为反复高烧持续5天以上，还伴有球结膜充血、口唇皲裂、手足硬性水肿等症状，体温可达39℃ - 40℃。