牙齿最里面的肉疼可能由以下原因引起：
1.智齿冠周炎：智齿是口腔中最后长出的牙齿，由于位置较深，容易导致食物残渣残留和细菌滋生，引起牙龈发炎、肿胀和疼痛。
治疗方法：可在医生的指导下使用甲硝唑、阿莫西林等药物进行治疗。如果症状严重，可能需要进行智齿拔除术。
2.牙龈炎：牙龈发炎是一种常见的口腔疾病，通常由细菌感染、牙结石等引起。
治疗方法：保持口腔清洁，定期洗牙，可在医生的指导下使用洗必泰溶液、过氧化氢溶液等含漱。
3.牙周炎：牙周炎是一种侵犯牙龈和牙周组织的慢性炎症，多由牙龈炎发展而来。
治疗方法：在医生的指导下使用甲硝唑、四环素等药物进行治疗。同时，还需要进行牙周治疗，如龈上洁治、龈下刮治等。
4.龋齿：龋齿是牙齿硬组织逐渐被破坏的一种疾病，如果不及时治疗，可能会导致牙髓炎、根尖周炎等并发症。
治疗方法：去除龋坏组织，制备洞形，使用牙科材料填充。如果龋坏严重，可能需要进行根管治疗。
5.其他：牙齿最里面的肉疼还可能与口腔溃疡、口腔肿瘤等疾病有关。
总之，牙齿最里面的肉疼可能是多种疾病的症状，需要及时就医，明确诊断，进行针对性治疗。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期进行口腔检查和洁治，有助于预防口腔疾病的发生。