瘦身咖啡可能存在多种危害。首先，部分瘦身咖啡中含有泻药成分，长期服用可能导致肠道功能紊乱，比如可能使肠道对泻药产生依赖，一旦停用，便秘问题可能会更严重，甚至有研究发现长期滥用含泻药成分的瘦身咖啡可能会影响肠道正常的蠕动和吸收功能长达数月之久。
对心血管系统的潜在影响
血压方面： 一些瘦身咖啡中添加的刺激性成分可能会使血压升高。有研究表明，连续饮用含有较高剂量刺激性物质的瘦身咖啡1 - 2周后，部分人群的收缩压可能会升高5 - 10mmHg左右。长期大量饮用还可能增加患高血压的风险。心率问题： 其中的某些成分可能会影响心脏节律，导致心率加快。对于本身就有心脏基础疾病的人群，如冠心病患者，可能会诱发更严重的心脏不适症状，像心悸等情况可能会频繁出现。
对神经系统的刺激
失眠风险： 瘦身咖啡里的咖啡因等成分具有兴奋神经的作用，容易导致失眠。有调查显示，连续一周每天饮用超过2杯含有较多咖啡因的瘦身咖啡，约有60%的人会出现入睡困难、睡眠浅易惊醒等睡眠问题，严重影响正常的休息和身体恢复。神经兴奋过度： 长期受到咖啡因等物质的刺激，神经系统可能会处于过度兴奋状态，出现烦躁不安、焦虑等情绪问题，还可能影响人的注意力和记忆力，导致工作学习效率下降。
对消化系统的损害
肠胃不适： 大量饮用瘦身咖啡会刺激胃黏膜，引起胃痛、胃胀、恶心等不适症状。特别是本身就有胃炎、胃溃疡等胃部疾病的人，饮用后病情可能会加重。有临床数据统计，约30%饮用瘦身咖啡后出现肠胃不适的人群本身有胃肠道基础疾病。营养吸收障碍： 由于肠道功能受到影响以及对胃黏膜的刺激，可能会干扰营养物质的正常吸收。比如影响对蛋白质、维生素等的吸收，长此以往可能导致营养不良，出现面色苍白、身体虚弱等情况。