男生第一次性行为时感到疼痛可能由以下原因引起：
1.生理结构：男性的生殖器官较为敏感，第一次性行为时，由于处女膜的破裂和阴道的扩张，可能会引起疼痛。
2.缺乏性经验：缺乏性经验可能导致男性在性行为中过于紧张或不熟练，增加疼痛的感觉。
3.性器官感染：性器官感染，如龟头炎、尿道炎等，可能导致疼痛、红肿等不适。
4.其他因素：性行为过于激烈、缺乏前戏、性伴侣的动作不当等也可能引起疼痛。
需要注意的是，如果疼痛持续时间较长、程度较严重，或伴有其他症状，如出血、肿胀、排尿困难等，应及时就医，进行详细的检查和诊断，以排除其他潜在的健康问题。
在初次性行为中，双方应充分沟通，尊重彼此的感受，采取适当的措施减轻疼痛，确保性行为的安全和舒适。同时，保持性器官的清洁卫生，避免感染的发生。如果对性行为或健康有任何疑虑，建议咨询医生或专业的健康顾问。