上完厕所尿道疼可能由多种原因引起。一般来说，尿道炎是常见原因之一，约30%的泌尿系统感染与尿道炎有关。
一、尿道炎导致
淋菌性尿道炎： 主要由淋病奈瑟菌感染引起，多通过性接触传播。除了尿道疼，还可能出现尿道流脓等症状。患者在确诊后需及时就医，医生可能会根据情况使用抗生素治疗。非淋菌性尿道炎： 常由支原体、衣原体感染所致，症状相对淋菌性尿道炎稍轻，可能有尿道刺痒、烧灼感等，也会出现上完厕所尿道疼的情况，同样需要用抗生素进行规范治疗。
二、膀胱炎引发
急性膀胱炎： 女性较为多见，主要是细菌感染膀胱引起。除了尿道疼，还可能有尿频、尿急等症状，严重时可能出现血尿。患者要注意多喝水，每天至少饮水1500 - 2000毫升，以增加排尿次数，冲洗尿道，帮助缓解症状，同时需遵医嘱使用抗生素。慢性膀胱炎： 多由急性膀胱炎迁延不愈而来，症状相对持续且可能反复发作，也会导致上完厕所尿道疼的情况，治疗上需要长期规范的处理，包括使用抗生素以及注意生活中的护理等。
三、尿道结石作祟
原发性尿道结石： 较少见，多在尿道内原发形成。当结石刺激尿道黏膜时，就会出现上完厕所尿道疼的现象，还可能伴有排尿困难等症状。如果结石较小，可通过大量饮水、适度运动等促进其排出；如果结石较大，则可能需要进行手术取石。继发性尿道结石： 多数是膀胱结石排入尿道所致，同样会引起尿道疼等不适，治疗方式需根据结石的具体情况来选择，比如较小的结石可能通过尿道外口取出，较大的可能需要手术处理。