新生儿湿疹的引发原因较为复杂，其中遗传因素是常见原因之一，约40%的湿疹患儿家族中有过敏、哮喘或过敏性鼻炎等遗传过敏史。
遗传因素相关
家族过敏史影响： 如果父母一方或双方有过敏性疾病，如过敏性鼻炎、哮喘等，新生儿患湿疹的几率会增加。研究发现，有家族过敏史的新生儿，湿疹发生率比无家族过敏史的新生儿高约2-3倍。基因易感性： 新生儿自身的基因也可能存在易感性，使得皮肤屏障功能较弱，更容易受到外界因素刺激而引发湿疹。
皮肤屏障功能不完善
皮肤角质层薄： 新生儿的皮肤角质层比成年人薄很多，约为成人的1/3，这使得皮肤的锁水能力和抵御外界刺激的能力较差，容易受到干燥、摩擦等因素影响，从而引发湿疹。一般新生儿出生后前几个月，皮肤屏障功能还未完全发育成熟，更易出现湿疹问题。皮脂分泌少： 新生儿皮肤表面的皮脂分泌相对较少，皮脂有保护皮肤的作用，皮脂分泌少会导致皮肤缺乏足够的保护，增加湿疹发生的风险。
外界环境刺激
衣物材质不适： 如果给新生儿穿了化纤材质的衣物，化纤材质不透气且容易引起皮肤过敏，可能会刺激新生儿皮肤引发湿疹。建议给新生儿选择纯棉材质的衣物，纯棉材质透气性好，对皮肤刺激小。环境温度湿度不适： 环境温度过高或过低、湿度过高或过低都可能诱发新生儿湿疹。比如室内温度长时间高于30℃，且湿度较大时，就容易让新生儿长湿疹；而室内过于干燥，空气湿度低于40%时，新生儿皮肤水分流失快，也易引发湿疹。