晚上背痛的主要原因有多种。比如，约有80%的腰背痛患者可能在晚上出现疼痛加重的情况，其中常见原因之一是脊柱关节退变。随着年龄增长，椎间盘会逐渐发生退变，水分减少，弹性下降，晚上休息时姿势相对固定，脊柱承受的压力分布不均，容易引发背痛。
肌肉劳损方面
长期不良姿势： 有些人白天长时间保持弯腰、伏案等姿势，比如长时间坐在办公桌前工作，或经常弯腰做家务等，会导致背部肌肉持续紧张，晚上休息时肌肉放松不彻底，代谢产物堆积，刺激神经引起背痛。一般这类人群每天大部分时间都处于不良姿势状态。运动过量： 如果白天进行了过量的运动，像长时间进行登山、跑步等运动，背部肌肉过度疲劳，晚上也可能出现背痛。通常过量运动后24~48小时内可能会有较明显的背痛表现。
脊柱病变方面
强直性脊柱炎： 这是一种慢性炎症性疾病，主要侵犯脊柱。患者常在夜间或清晨出现腰背部僵硬、疼痛，活动后症状可缓解。这种疾病好发于16~30岁的青壮年男性，病情会逐渐进展，影响脊柱活动度。腰椎间盘突出症： 当腰椎间盘突出时，突出的椎间盘可能压迫周围神经，晚上睡觉时姿势改变，可能导致神经受压加重，从而引起背痛。尤其是本身有腰椎间盘退变基础的人，更易在晚上发病。
内脏疾病牵涉痛方面
肾脏疾病： 如肾结石、肾炎等。肾脏位于腰部后方，当肾脏出现病变时，可能会牵涉到背部疼痛。例如肾结石患者，结石刺激肾脏包膜或输尿管，晚上卧位时可能会感觉背痛，且疼痛可能比较剧烈。胆囊疾病： 胆囊炎、胆结石等胆囊疾病有时也会引起右肩背部放射性疼痛，晚上休息时也可能出现这种牵涉痛，一般还可能伴有右上腹的不适、恶心等症状。