女性尿路感染主要是细菌等病原体入侵尿路引起的，其中大约80%的尿路感染是由大肠埃希菌引起的。
解剖结构因素
女性尿道特点：女性尿道较短，一般只有3~5厘米，而且尿道外口靠近阴道口和肛门，这就使得细菌更容易从这些部位侵入尿道并上行感染。比如，肛门周围的细菌很容易传播到尿道，增加感染风险。生理结构影响：女性在经期时，局部抵抗力下降，加上经血的刺激，也更容易引发尿路感染。另外，性生活也可能对尿道产生机械性刺激，将细菌带入尿道，从而增加感染几率。
个人卫生习惯因素
不注意外阴清洁：如果女性不经常清洗外阴，尤其是不注意经期和性生活前后的清洁，会导致细菌在外阴部滋生，进而侵入尿道引发感染。例如，长期不更换卫生巾，会让局部处于潮湿且细菌滋生的环境中。清洁方法不当：不正确的清洁方式，比如从肛门往尿道方向擦拭，会把肛门周围的细菌带到尿道附近，增加感染风险。应该从前面往后面擦拭外阴。
机体抵抗力因素
孕期抵抗力变化：女性怀孕时，体内激素水平改变，输尿管蠕动减慢，尿液排空不畅，而且增大的子宫会压迫输尿管，使得尿液潴留，为细菌生长繁殖创造了条件，所以孕期女性更容易发生尿路感染。糖尿病患者：糖尿病患者由于血糖升高，尿液中含糖量增加，有利于细菌生长，同时机体抵抗力相对较低，容易发生尿路感染。据统计，约有1/3的糖尿病患者会合并尿路感染。