导致怀孕16周小腹隐隐作痛的原因较多，主要包括子宫增大、假性宫缩、情绪变化、先兆流产、炎症性疾病等。
一、子宫增大：随着胎儿的不断增长以及羊水的逐渐增加，女性的子宫会逐渐变大。在怀孕16周时，子宫增大过程中会对两侧的圆韧带产生牵拉，从而导致左下腹或右下腹出现隐痛的情况。
二、假性宫缩：到了孕中期，即怀孕16周，子宫可能会出现间断性的轻微收缩，这也会引发小腹隐痛。这种宫缩导致的隐痛通常比较轻微，经过一段时间的休息往往能够缓解。
三、情绪变化：比如家中发生争执或孕妇有抑郁倾向等因素，会致使孕妇出现情绪异常、失眠等状况，这会刺激孕妇产生子宫不规则收缩，进而表现出小腹隐痛的症状。如果情绪异常严重，还可能引起不规则出血、早产等更为严重的后果。
四、先兆流产：是指在怀孕28周前，出现少量阴道流血以及下腹疼痛，此时宫口未开且胎膜未破，仍处于怀孕状态。若怀孕16周出现小腹隐痛，在休息以及时间推移后，不仅没有消失和减轻，反而呈现逐渐加重的趋势，甚至出现阴道出血等情况，就可能属于先兆流产。
五、炎症性疾病：如在怀孕16周时出现慢性阑尾炎急性发作、肠道感染、慢性盆腔炎症等炎症性疾病，炎症反应释放的炎症因子会刺激小腹部的组织或器官，从而产生小腹隐痛的症状。此外，如果怀孕16周合并有子宫息肉、子宫肌瘤、卵巢肿瘤、肠道肿瘤等占位性病变，由于病变部位对周围组织的牵拉，也会出现小腹隐痛的现象。
总之，女性怀孕16周已进入孕中期，流产的概率相对较低，但如果小腹隐隐作痛的不适症状持续加重，就需要及时到医院就诊，查明原因并进行针对性治疗。