肾有轻微疼痛可能是由多种疾病引起的，比如慢性肾炎、肾结石、肾囊肿等。
一、慢性肾炎：当肾脏发生炎症感染时，其包膜以及周围神经可能会受到刺激，进而出现肾有轻微疼痛的表现。这时需要及时就医，必要情况下，可在医生指导下使用一些药物来治疗，比如：
1.雷公藤多甙片：具有较强的抗炎及免疫抑制作用。
2.百令胶囊：可补肺肾、益精气。
3.金水宝胶囊：有补益肺肾、秘精益气的功效。
二、肾结石：若肾脏部位有结石出现，当结石较大时，就会对肾脏形成刺激从而引发疼痛，部分患者还可能伴有血尿现象。治疗上可选择体外碎石，也可采取手术取石的方式。
三、肾囊肿：这是一种良性病变，因囊肿会对周围组织产生刺激，所以导致肾脏疼痛，并且随着囊肿的逐渐增大，患者的疼痛症状可能会越发严重。通常可通过手术切除的方法进行治疗。
总之，当肾出现轻微疼痛时，不可忽视，应尽快明确病因，并根据具体情况选择合适的治疗方法。