40天孕囊大小通常约为1.5cm左右，不过具体情况和受孕时间、月经周期、受精卵发育不良等因素紧密相关。
一、受孕时间：孕囊大小往往和受孕时间有联系。如果排卵较早，那么会较快形成受精卵，受精卵越早着床，其孕囊发育就会越好。而受精卵着床晚的话，孕囊的发育就会相对较慢。
二、月经周期：女性正常的月经周期一般是28至35天，正常怀孕40天时孕囊为1.5cm，但要是月经周期过长或过短，都会致使孕囊偏大或偏小，不过正常误差大概在一周左右。
三、受精卵发育不良：当受精卵发育不良时，细胞分裂的速度就会变慢，进而导致孕囊大小和正常大小出现较大差异。在怀孕前期需要多注重休息，多吃蔬菜和水果，补充营养与叶酸，身体若有不适，应及时前往医院并在医生指导下进行处理。
总之，40天孕囊大小受多种因素影响，怀孕早期要做好各方面的护理和关注。